Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms