Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac5Q9Z2V6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms