Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crlf3Q9Z2L7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms