Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptgdr2Q9Z2J6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms