Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3Q9Z2D8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms