Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd4Q9Z2D7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms