Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms