Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms