Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shcbp1Q9Z179 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1Q9Z179 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms