Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms