Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn9Q9Z0S7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn9Q9Z0S7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cldn9Q9Z0S7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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