Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cib1Q9Z0F4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cib1Q9Z0F4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cib1Q9Z0F4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cib1Q9Z0F4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms