Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clcn5Q9WVD4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms