Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapaQ9WV55 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapaQ9WV55 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms