Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lemd3Q9WU40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lemd3Q9WU40 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms