Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd7Q9WTY1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms