Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp18Q9WTV6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms