Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms