Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Psma1Q9R1P4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms