Protein–RNA interactions for Protein: Q9R100

Cdh17, Cadherin-17, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh17Q9R100 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh17Q9R100 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdh17Q9R100 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms