Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc3Q9R0B6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc3Q9R0B6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lamc3Q9R0B6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms