Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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