Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ercc4Q9QZD4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms