Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Six6Q9QZ28 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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