Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc5Q9QX29 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms