Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms