Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms