Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dkk3Q9QUN9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms