Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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