Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl2Q9QUK0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms