Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Rabgef1Q9JM13 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rabgef1Q9JM13 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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