Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mrpl39Q9JKF7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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