Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms