Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ybx3Q9JKB3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms