Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uchl3Q9JKB1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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