Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms