Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ddx20Q9JJY4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
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