Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra4Q9JJT2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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