Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJD0

Thap11, THAP domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap11Q9JJD0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Thap11Q9JJD0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thap11Q9JJD0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms