Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc86Q9JJ89 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms