Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms