Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms