Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn12Q9ET43 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms