Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms