Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ush1cQ9ES64 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms