Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb3Q9ERD7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms