Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Vmn1r44Q9EQ47 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r44Q9EQ47 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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