Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trmt112Q9DCG9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms