Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hmgn3Q9DCB1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hmgn3Q9DCB1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hmgn3Q9DCB1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hmgn3Q9DCB1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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