Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc46a3Q9DC26 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms